home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ Shareware Overload Trio 2 / Shareware Overload Trio Volume 2 (Chestnut CD-ROM).ISO / dir26 / med9410p.zip / M94A3299.TXT < prev    next >
Text File  |  1994-10-25  |  2KB  |  39 lines
  1.        Document 3299
  2.  DOCN  M94A3299
  3.  TI    In vivo interaction of HIV-1 Rev with an extended Stem I duplex
  4.        structure of Rev response element RNA.
  5.  DT    9412
  6.  AU    Kimura T; Department of Microbiology, Kansai Medical University, Osaka,;
  7.        Japan.
  8.  SO    Int Conf AIDS. 1994 Aug 7-12;10(1):108 (abstract no. PA0049). Unique
  9.        Identifier : AIDSLINE ICA10/94369276
  10.  AB    OBJECTIVE: Experiments were designed to study whether the packaging
  11.        reaction of HIV-1 Rev with Rev response element (RRE) RNA reported in
  12.        vitro mediates Rev function in vivo. METHODS: RRE activity was examined
  13.        using HIV-1-derived reporter plasmids, which contained the bacterial
  14.        chloramphenicol acetyltransferase (CAT) gene as a reporter. RESULTS: The
  15.        originally defined 234-residue RRE failed to show the full Rev response
  16.        when inserted in a test plasmid that lacks the flanking env sequences. A
  17.        computer search for additional RNA secondary structures in the flanking
  18.        regions revealed an alternative 351-residue complete RRE, which carried
  19.        an extended Stem I duplex RNA structure. Mutations in the complete RRE
  20.        that disrupted either the primary Rev-binding bubble within Stem-loop II
  21.        or the duplex RNA structure in the extended Stem I region showed reduced
  22.        CAT activities with various degrees. DISCUSSION AND CONCLUSIONS: The
  23.        mutagenesis studies showed that the 351-residue complete RRE rather than
  24.        the original 234-residue RRE was required to exert the full
  25.        Rev-responsiveness in vivo. For the full responsiveness, it was found
  26.        that association of Rev with RRE was to be initiated with the
  27.        recognition of the functional bubble structure in the Stem-loop II,
  28.        followed by the interaction with the neighbouring duplex RNA, including
  29.        the elongated Stem I structure.
  30.  DE    Binding Sites/GENETICS  Chloramphenicol Acetyltransferase/GENETICS  Gene
  31.        Products, rev/CHEMISTRY/*GENETICS/*METABOLISM  Genes, env  Genes,
  32.        Reporter  Human  HIV-1/*GENETICS/*METABOLISM  In Vitro  Mutagenesis
  33.        Nucleic Acid Conformation  Plasmids/GENETICS  RNA,
  34.        Viral/CHEMISTRY/GENETICS/*METABOLISM  MEETING ABSTRACT
  35.  
  36.        SOURCE: National Library of Medicine.  NOTICE: This material may be
  37.        protected by Copyright Law (Title 17, U.S.Code).
  38.  
  39.